Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNRPEP62304 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms