Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ERVFC1-1P60608 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVFC1-1P60608 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms