Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM3BP58499 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms