Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARL4CP56559 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL4CP56559 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARL4CP56559 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms