Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL23P55773 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL23P55773 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL23P55773 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL23P55773 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL23P55773 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL23P55773 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL23P55773 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms