Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATN1P54259 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATN1P54259 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms