Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FNTAP49354 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FNTAP49354 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms