Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms