Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTTP42858 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTTP42858 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTTP42858 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTTP42858 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTTP42858 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTTP42858 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTTP42858 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTTP42858 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms