Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP7BP35670 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP7BP35670 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms