Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC13P31276 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms