Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GCAP28676 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GCAP28676 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GCAP28676 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GCAP28676 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GCAP28676 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GCAP28676 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GCAP28676 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms