Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCNA2P20248 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms