Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ITGB4P16144 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGB4P16144 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms