Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRFP10586 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRFP10586 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms