Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPBP07199 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPBP07199 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPBP07199 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPBP07199 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms