Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGKV1-5P01602 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms