Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
STAMBPO95630 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms