Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACSL3O95573 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSL3O95573 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms