Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11FIP3O75154 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11FIP3O75154 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms