Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF3O43395 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF3O43395 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms