Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYNMO15061 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYNMO15061 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms