Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms