Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIP1O00291 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIP1O00291 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms