Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DFFAO00273 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DFFAO00273 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DFFAO00273 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DFFAO00273 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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