Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLDN25C9JDP6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN25C9JDP6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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