Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC160A6NGH7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC160A6NGH7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms