Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
C9orf92A6NGG3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C9orf92A6NGG3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms