Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSC5DA1L4H1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSC5DA1L4H1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms