Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYCE3A1L190 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYCE3A1L190 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms