Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTCH1Q13635 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CNPY1-201ENST00000321736 2378 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTCH1Q13635 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTCH1Q13635 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTCH1Q13635 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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