Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 FO393415.1-201ENST00000314481 2255 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TIGIT-201ENST00000383671 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 OR2W5-203ENST00000641857 1597 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ALDH6A1-206ENST00000555126 1382 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CACNB4-206ENST00000439467 2159 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC01235-201ENST00000604724 2328 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HVCN1-207ENST00000548312 1301 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 OTUD6B-205ENST00000615618 3434 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AARS2-201ENST00000244571 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL512506.3-201ENST00000627615 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL353662.2-201ENST00000372214 645 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TPM3P6-201ENST00000391998 742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL365223.1-202ENST00000425027 780 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LINC02521-201ENST00000440848 834 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC092431.2-201ENST00000441658 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LMCD1-AS1-207ENST00000458666 581 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL683P-201ENST00000460552 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL465P-201ENST00000468411 301 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC092639.1-201ENST00000509651 734 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ABT1P1-201ENST00000511060 821 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 FGF12-AS1-202ENST00000530635 555 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC090912.2-204ENST00000583086 571 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SNX18P5-201ENST00000619873 868 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC004264.2-201ENST00000623328 1737 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF620-201ENST00000314529 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZNF221-204ENST00000592350 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CCL22-201ENST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP000977.1-201ENST00000501964 2908 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RAB30-201ENST00000260056 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PSMD10-201ENST00000217958 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CEP63-203ENST00000354446 1835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CEP85-209ENST00000640292 2286 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP44-201ENST00000262444 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 LMOD3-202ENST00000475434 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AP001425.1-201ENST00000632732 1940 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ITGA10-204ENST00000539363 4735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1S-202ENST00000367338 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 553.1 ms