Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSC4Q9Y5U2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms