Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHKBQ9Y259 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHKBQ9Y259 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms