Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA3Q9UL41 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA3Q9UL41 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms