Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC9Q9UKV0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC9Q9UKV0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms