Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MBD2Q9UBB5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms