Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTN3Q9P232 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTN3Q9P232 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms