Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBM28Q9NW13 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBM28Q9NW13 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms