Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC39A9Q9NUM3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms