Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PDS5BQ9NTI5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms