Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMYD2Q9NRG4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMYD2Q9NRG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms