Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BATF3Q9NR55 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BATF3Q9NR55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms