Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD1Q9GZZ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD1Q9GZZ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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