Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCAPERQ9BY12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCAPERQ9BY12 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms