Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BBS2Q9BXC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms