Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms