Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THUMPD2Q9BTF0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms