Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GAL3ST1Q99999 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms