Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBBP8Q99708 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms